随着“退林还耕”政策的实施，苗圃用地在缩减，地租成本越来越高，为了让土地价值最大化，苗木套种是一种不错的选择。在同一地块，种上高中矮三种或两种不同高度的苗木，利用其生长空间的错位，最大限度地发挥空间作用，其中尤以三层立体套种利用率最高。
套种模式的经营周期通常要5至10年，上层栽植落叶乔木，株行距至少3米×2米，以培育干茎和良好的树冠为目的。前期可套种常绿花灌木，应适当密植，如作为球形培养，株行距可定为1米×1米；如作为色块类，株行距宜设为20厘米×30厘米。
但对于下层苗木，资金回转快，对培养上层的长线产品形成了强有力的经济支撑。
沿用这套模式做到高产比较容易，不过经济效益如何还得看树种的选择：落叶乔木可选择银杏、法桐、国槐、元宝枫、玉兰等树种，其经营时间长、经济价值高、苗越大越值钱；常绿花灌木选择大小叶黄杨、法国冬青、金叶女贞、龙柏等，其经营时间短、规格小、种植1至2年即可上市销售；地被植物选择麦冬、玉簪、萱草、鸢尾等，都属于市场需求大的宿根植物。
苗木套种的原则
1、套种的苗木要求较小
2、株行距较大，高矮搭配
3、阳性树种与阴性树种苗木搭配
4、深根性与浅根性树种苗木搭配
5、相互之间不能成为病虫害的中间寄主
6、生态习性尽可能不同
适合套种的植物群落模式
1、毛白杨——元宝枫+碧桃+山楂——榆叶梅+金银花+紫枝忍冬+白皮松(幼)——玉簪+大花萱草
2、银杏+合欢——金银木+小叶女贞——品种月季——早熟禾
3、国槐+桧柏——裂叶丁香+天目琼花——崂峪苔草
4、毛白杨+栾树+云杉——珍珠梅+金银木——崂峪苔草
5、国槐+白皮松——花石榴+金叶女贞+太平花——崂峪苔草
6、大叶白蜡+馒头柳+桧柏——麻叶绣线菊+连翘+丁香——宽叶麦冬
7、悬铃木+银杏+桧柏——胶东卫矛+棣棠+金银木——扶芳藤+崂峪苔草
8、银杏+合欢+白皮松+栾树——金银木+天目琼花+忍冬+紫叶小檗——金银花+金叶女贞
9、华山松+馒头柳+绒毛白蜡+西府海棠——紫丁香+连翘+紫珠——金银花+大花萱草+崂峪苔草
10、油松+元宝枫——珍珠梅+锦带花+迎春——冷季型混播草
立体套种的优势
1、空间利用率极高
苗木冠幅在高中低三层错开生长，空间利用率很高，单位面积能够产生更大的效益。
2、可以有效遮挡阳光
对于某些怕强光照射的苗木（如鸡爪槭），可利用高层苗木来遮挡强光直射，同时也可利用中层苗木来遮挡阳光对高层苗木主干部位的直射。
3、能实现“一定终生”
三层立体套种总体上较密集，而其高中矮三层苗木各自冠幅位置不同，因此无需像普通栽培方式那样每当苗木生长到一定阶段就得间苗拉稀。这样三层立体套种可以不用间苗移栽，节约了定植移栽成本（定植移栽成本极高）。
4、可提高苗木防冻抗旱能力
由于三层立体套种栽培密度较大，各苗木就像增加了一道挡风的墙，能减少寒风对苗木的肆虐。特别对于部分怕冻的落叶树而言，若旁边有常绿树，会大大减少寒风的伤害。抗旱原理也相同，密度大、光照弱、湿度大。
立体套种的劣势
1、病虫害防治麻烦
相同种苗木间距较大，中间有其他苗间隔，打药不方便。
不同苗木对农药敏感度不同，使得可选农药面窄或打药时间、操作技术等要求更高。
不同苗木病虫害发生时间不同，较难统一防治，或统一防治时要增加很多农药成本及降低防治效果。
2、杂草管理麻烦
由于有低矮作物，同时密度较大，治草相当麻烦。
3、提高了部分病虫害侵染和繁殖概率
由于密闭度大和光照不足，中矮层作物增加了不少病虫害侵染概率，如白粉病、蜡蚧等多种病虫害就喜欢这种遮阴环境生长。
除了套种苗木之外，还可以苗木套种蔬菜、食用菌、茶叶、药材等。
苗木套种宜选择对水分、土壤等生态因子要求相近的药材，比较好种植的中药材如板蓝根、柴胡、桔梗、甘草、金银花等，对土壤要求不严，适应性强，与大多数苗木生长习性相近，适合平原地区和丘陵的土质和气候。
苗木套种药材可以根据地区的气候条件及苗木林下空间的大小来选择种类。处于生长期枝叶疏朗的乔木或干性强的松柏，行距内形成了一定的隐蔽空间，透光率在30%~70%，可以选择种植一些喜半阴的中药材，如金银花、射干、柴胡等。如：雪松套种金银花，法桐、雪松、红叶石楠套种柴胡，樱花套种桔梗、百合。
处于幼年期的乔木或一些低矮的园林灌木，由于树冠较小，几乎不能形成遮阴的功效，在这样的苗地可以套种茎杆低矮、株型瘦小、喜阳的中药材品种，如桔梗、柴胡、板蓝根、甘草等，可达到减少土壤养分流失、抑制杂草生长目的。如：法桐、雪松、红叶石楠、桂花等套种板蓝根、甘草。
移栽5年以上树冠浓密的乔木，林下透光度30%以下，可以选择种植一些耐阴的中草药材，如三七、黄连、黄精。如雪松、法桐套种黄精、三七。
杨树林下间作的药材品种主要有芍药、天麻、白术、贝母、板蓝根、薄荷、山药、金银花等。林药间作，林木为药材提供蔽荫条件，以防夏季烈日高温伤害。对于贝母、白术等偏阴性植物，可为其提供阴湿的环境。同时，林下间作药材大多采用集约化的精耕细作，有利于改良土壤理化性状，增加肥力，促进林木速生。合理的林－药复合经营，能使林下种植药材保持较高的产量。
旱地果园只适合套栽耐旱药材，如柴胡、黄芩、黄芪、知母等。水浇地可套栽较喜湿润、不耐寒的元胡、附子、北沙参等。山区应套种喜湿、怕热的黄连、党参、麦冬、西洋参等。要根据树种套栽枣树、柿树等发芽较迟的果树，可套栽喜光但有夏眠习性的贝母、元胡等。桃、杏、樱桃、枇杷等果熟期在最热月份到来之前的果园，可套栽喜热怕践踏的茯苓等菌类药材，还可挂袋生产木耳和银耳。要根据树龄套栽幼龄果园因尚未封行,可在行间栽培1～3年收获的地黄、远志、黄芩、菊花、黄芪、牛膝、板蓝根、草决明、柴胡等喜光药材。成龄果园则应选择喜阴或耐阴的药材套种。
树冠及树叶较稠密的果树，如桃、樱桃、杏、葡萄、柿子等，可套栽半夏、天麻、灵芝、黄连等喜阴湿的药材。树冠较稀疏的果树，如苹果、梨、山楂等则可套栽丹参、百合、天门冬等稍耐阴湿的药材。
枣树、柿树等发芽较迟的果树，可套栽喜光但有夏眠习性的贝母、元胡等。桃、杏、樱桃、枇杷等果熟期在最热月份到来之前的果园，可套栽喜热怕践踏的茯苓等菌类药材，还可挂袋生产木耳和银耳。
