1工业发酵法
利用发酵塔、发酵罐、发酵砖窑来控温、控氧、控湿和机械搅拌等措施快速发酵，进行大规模集约化轻型基质的生产。在工业发酵法实施的同时还可以回收、分离大量有较高经济价值的有机化合物副产品，使资源得到充分利用，但一次性投资大。
2简易发酵法
发酵场地建在室外背风向阳处，以水泥地面为好，地面设有凹槽，槽里放置通气的厚壁塑料管道，管径15厘米，管长30米，两条管道之间距离2米，管上钻孔，孔径10毫米，孔与孔之间距离7厘米,均匀排列。两条管道一端用支管连接到1台1~2千瓦的鼓风机上，接口处密封使其不漏气，两条管道的另一端塞住不透气，以便在其后发酵的过程中，通过鼓风机和管道适时将空气送入堆积物料的各部位，用来控制发酵进度和发酵质量。然后将待发酵物料堆放在通气管道上面。
发酵堆积的参考尺寸:30m(长)X6m(宽)X3m(高)。物料中添加易发酵的有机质，如动物粪便，食用菌废料，某些菌肥及氮肥、磷肥，然后搅拌均匀堆放。堆的顶部架设喷水管道，管道上有喷水孔，用水浇透。
最后，盖上透明塑料布。为了能及时补充因发酵而减少的氧气，以及补足发酵升温和蒸发减少的水分，可用不锈钢管专门制成3米长的温度传感器，插到堆料的某一位置。传感器一般至少要2个，将传感器的导线连接到控制仪上，设定温度控制，比如设定在50℃，当堆料发酵温度升到50℃时，鼓风机启动，开始鼓风，以补充基质由于产生发酵而缺少的氧气；同时也可将控制仪连到喷水管上，同时向堆料补充水分。如有条件，还可用更准确的氧分压传感器和湿度传感器，监测发酵过程，进行自动补水补气，促使快速发酵。
发酵时间长短主要是发酵物的成分和发酵温度升高的快慢，一般需2~3个月以上，添加外源菌种后会缩短至1个月。如果是人工监测，当温度超过70℃时要防止自燃。一般2周浇水1次，1 ~2个月翻堆1次。当温度从高温自然降到30℃以下时，应人工翻堆，再浇透水，进行第2次发酵；一般二次发酵温度可升到45℃,然后温度降到常温时发酵结束。
3传统发酵法
将作物的秸秆、林地的枯枝落叶等农林废弃物采取堆积或堆沤的方式进行处理，变成易被植物吸收的无毒害作用的物质。这种方法也是我国农村历史上用来生产有机肥料的常用方法，至今还在使用。
也正因如此，才使得耕作多年的土地不易发生板结、退化和肥力流失。以农林废弃物为主要原料生产肥料和加工成轻基质有很多相似之处，不同之处在于发酵后的物料中添加土壤比例大小不同而已。
传统发酵法充分利用了自然光和热，是一种集资源处理与资源再生利用为一体的生物方法，利用简便易行，但堆积占地面积大，发酵时间长，资源不能充分利用。
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