只注重果树地上部分的管理是传统管理的一个方向，多注重对果树的修枝整形、打药防病、疏花疏果、环剥促果等等。而现代的果树管理观念，更多的会把方向转为根系管理，因为果树的根系才是果树的命脉所在，所以从“重树上”向“重树下”管理转变就成了一种必然。
在果树的管理中，有人总结了几句话特别到位，即“地上要通风透光、地下要吃饱喝足、中间要防控结合”。这几句话的意思就是要注意树冠的通风，该修剪则修剪，地下部分的根系需要平衡水肥，中间的树干则需要防病控果。如果非要分轻重的话，应该根系第一，树冠次之。
有句话叫“树是地上的根，根是地下的树”，这说明根对果树非常之重要，只有“根深”才能“叶茂”。不过只注重管根也不行，同时也得注意树冠的管理，因为根与树冠两者之间是密切相关的，在果树年生长周期中，二者处于动态平衡状态。树冠为根的生长发育提供有机养分、水肥、阳光，而根系则对土壤中的水分和各种无机养分的吸收，通过树干中部的导管等将光合作用需要的水及其他养分运至地上部，促进树冠生长。
所以，只注重任何一方面的管理都不行。因为在传统的果园管理中，长期只注重对树冠的管理而忽略了根系的管理，对此，在现代化的科学管理中，有人提出，需要加强根系的管理，对果树地下部分的管理是果园现代管理的一个方向。而对根系的管理，主要有以下几个方面的措施：
一、土壤管理
良好的土壤结构是根系活性发挥的基础。从定植果树苗木开始，对根系土层进行深翻和改良，以满足其对空气的需求，在土壤降雨或者积水时，及时排水、松土，都是很好的管理措施。通过这些管理，随着植株的生长，将根系逐步向深层土壤区域引导，可以提高其吸收利用土壤深层水分的能力，同时，也提高了果树对不良环境，尤其可以提升对季节性缺水的抗御力。具体的方法有深翻改土、果园间作、土壤耕作、地膜覆盖等等。
二、合理施肥
合理施肥就是要根据果树根系和果树生长需求确定施肥时间、肥料种类、施肥方法。果树管理中的几个关键时期有：营养生长看前期、病虫防治在春季、当年产量在花期、来年产量看夏季、储藏营养在秋季、树势调整在冬季。如果掌握好这几个关键时期，该怎么给果树施肥就容易了。不过，要注意的是多注重有机肥、无机肥相结合的施肥方法，让有机肥中的微生物发挥肥料蓄积和转化作用。
三、合理灌水
灌水就是要根据果树物候期和气候、土壤情况来确定果树的灌输时期、灌水方法和灌水量，以保证果树萌芽期、开花前后、幼果膨大期、果实成熟期的水分需求。缺水时要及时给水，水多时要排水。在灌水上，需要掌握好时间，一般是旺长无花时，应当控水；多花弱树，花期灌水，可适当加强新梢生长但不会引起旺长，花少树旺，花期灌水，容易引起梢叶旺长，争夺养分，加剧落果。
总之，果树的根系是决定果树产量的关键，只有充分管理好根系，才能有强大的挂果枝组，树冠才能强大，强大的树冠又才能成为根系有机养料的来源，从而增加果园的生产效益。但只单纯注重根系管理也不行，还得注重地上部分的树干和树冠的管理，采取措施让树冠多开花结果，又才能达到丰产的目的。
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