1996年9月1日在南昌市改选换届，成立第二届理事会，由江西省农业厅厅长刘初浔任会长；魏应宽、周鑫群、卢耀章任副会长；段可德任秘书长，汪一兵、蒋新华、高九荣、汤伟忠、周晓萍任副秘书长。协会仍然挂靠省农业厅。本届理事会增设了名誉会长和顾问，由省政府顾问许少林、省委副书记舒惠国、省人大副主任张逢雨、省政府副省长孙用和、省财政厅厅长雍忠诚、省农办主任卢联灿、省农牧渔业厅原厅长王希仁7位同志任名誉会长；王天德、余欣荣、韩京承、曾正国、刘极灿、万美林、李以镔等7位同志任顾问。
2002年11月21日在南昌市改选换届，成立第三届理事会，刘初浔任会长；周鑫群、张廷杰、卢耀章、蒋新华任副会长；段可德任秘书长，汪一兵、高九荣、汤伟忠、王树春、周晓萍、王苹、郑丰生、姚技任副秘书长。协会继续挂靠省农业厅。 第三届理事会组织机构设有办公室、江西省花协盆景艺术专业委员会、兰花分会、杜鹃分会、山茶花分会及花卉苗木企业家联合会等分支机构。省花协有有专职人员4人，兼职人员10人。
协会地点：南昌市北京西路省政府大院、省农业厅院内
邮政编码：330046
