目前，除位于北京市海淀区百旺山下的药用植物园北京总所之外，中国医学科学院药用植物研究所还设有云南、海南、广西、新疆四个分所，是世界上五大药用植物专业研究机构之一，也是国内顶尖的从事中药研究的专业机构。
云南西双版纳南药园
西双版纳南药园隶属于中国医学科学院药用植物研究所云南分所，位于云南省西双版纳州首府景洪市中心，占地约250亩，是国家AA级旅游景区、云南省科普教育基地。
园内引种收集南药、民族药及其他药用植物1200余种，其中包括阳春砂仁、白豆蔻、檀香、金鸡纳等30多种名贵南药，以及国内人工种植年限最长的土沉香、印度紫檀等重要南药。
走进园区，首先来到的是药文化广场，栩栩如生的傣医药文化雕塑，展示了民族医药的神奇历史。沿着“药文化”的主线，依次走进南药秘园、荫园、百草园、兰园、傣药园、槟榔园、秀园、胖大海种质园、景园、南药科技馆等十个特色区域，体会灿烂的中国医药文化，从而把博大精深的中药文化和具有浓郁民族特点的傣医药文化与药用植物有机融合。票价：30元
广西药用植物园
中国医学科学院药用植物研究所广西分所位于广西南宁市郊，占地面积220公顷。
药物园划分为广西特产区、药物疗效区、荫生植物区、木本药物区、草本药物区、藤本药物区和药用动物区等7个药物区，集南药、北药、本区特产药物和区外、国外药物于一园。目前，园区已引种栽培药用植物近3000种，比李时珍的《本草纲目》记载的植物药种还多1000多种，被誉为“立体《本草纲目》”，是目前亚太地区规模最大，种植药用植物品种最多的专业性药用植物园。
近年来，广西药用植物园开发了多项旅游项目，利用园内的药物作为原材料，开发了药膳粥、药膳汤、保健茶、烧烤等项目。使游客在休闲、娱乐的同时，还能学到中草药保健知识。票价：本地人15.00元，外地人65.00元（含导游和半小时中药足浴）。
海南兴隆南药植物园
兴隆南药园隶属于中国医学科学院药用植物研究所海南分所，位于海南省万宁市兴隆风景旖旎的太阳河畔，占地13余公顷。
目前园内引种栽培植物有201科1598种，建立了“珍稀濒危南药引种区”、“海南特色药园区”、“原生态药园区”和“进口南药园区”等，是目前我国收集保存南药资源最多的研究机构之一。
兴隆南药园引种保存国家一级珍稀濒危保护植物黑桫椤、坡垒、海南苏铁、苏铁、华南苏铁、金花茶等6种，国家二级珍稀濒危保护植物26种和三级珍稀濒危保护植物10种，从印尼、马来西亚、越南、印度、泰国、缅甸、柬埔寨等地成功引种栽培各种珍稀药用植物22种。
槟榔是我国四大南药之一，其榔玉（核）、果皮、花苞等都可入药。
