1、叶子区别：红豆杉公树的叶子要大一些，比较的直立，颜色相对偏浅，分布的有些稀疏。母树的叶子跟公树比有些区别，叶子比较的短小，摸起来厚实一些，颜色看起来也比较深，生长分布的很密集。
2、花朵区别：红豆杉可以通过花朵来区分公母，这是比较明显的方法。红豆杉的雄花呈现为球形，花蕾比较大，看起来也很明显，里面具有圆形的花苞，花朵下面有比较短小的花梗。雌花就看起来比较小，形状属于近球形，看起来也不明显，并且底下没有花梗。等到开花之后，可以通过这个方法分辨。
3、生长速度区别：公树的生长速度比较快，母树的生长速度慢一些，只不过这个区分方法不明显，需要两者对照才能看出来。
4、结果区别：公树是只会开花，但是不会结果的，母树经过公树授粉之后，就能结出果子。
5、生长位置不一样，比如雄花蕊是生长在叶腋当中，而雌花蕊是生长在花轴的上部；
6、形态不一样，通常雌花蕊有一个胚珠，胚珠呈卵形，颜色呈淡红色。
