好的排水是屋顶花园设计最重要的要求。排水管道只要发生了阻塞，就可能导致植物的死亡，并使水渗透至附近的建筑物，最终将导致昂贵的维修和清理工作。设计得好的排水系统能够提供干净而可靠的屋顶表面，所以我们对屋顶绿化排水材料就得要有针对性的选购，这对于屋顶花园的维护和美观是十分必要的。
排水系统由两个紧密相连的部分组成。第一部分是一层排水材料．它位于屋顶的混凝土防护板的上方，第二部分则是由排水沟和排水管共同构成的排水系统，它将水引入屋顶的落水管，并由此进入城市的污水管道。此外，调称系统的成功与否，也部分地取决于排水层上方的各层，种植层的类型以及是否建有油布层等，都直接影响排水系统的效能。所以我们在建造的过程当中，必须时刻考虑到上述问题的存在。
排水材料
排水层一般是抗腐蚀的材料组成，水透过这一层可以流向大楼屋顶的排水管道。排水层可以使用的材料范围较广，一些是传统材料，而还有一些则是最近才研制出来的新产品。
在现代建筑中最早使用的排水材科由卵石、碎石和渣块(烧过的碎砖块)组成。
也许这些材料的排水效果对于屋顶花园来说，还算不上是最为理想，或者也可能是后来的设计者们不太了解这个方法。无论出于何种原因，以后兴建的花园中我们郡看不到这些排水材料的踪影。尽管经过时间的考验，证实它们确实有效，但是它们的确存在一定的缺陷(比如重量)。
在以前，排水材料只是简单的一层碎石，厚度一般为10厘米，石块的直径通常在3厘米，而且上面也不铺设任何过滤材料。虽然碎石的排水效果良好，但是对于那些不能承受太多重量的屋顶而言．则显得太重，而且搬运和施工需要耗费大量的劳力。而没有铺设过滤材料则导致上层的土壤被冲进石块之间的缝隙，从而将它们堵住，或是进人大楼的屋顶排水口并被彻底冲走。在20世纪创年代中期．开始在碎石的表面增加一层滤布，这样就既保证了水流的通畅又能防止土壤的流失。不过碎石作为排水材料依然存在着其他一些缺陷。
随着时间的推移，花园的设计者终于发现了最为适宜的防水材料，这种材科原本被用于其他用途。例如后来出现了一种产品，它是为在车流量较少的地方铺设草皮而设计的。这种材料名叫植草格，由耐压的塑料制成，呈蜂巢状，由许多六角形的空槽组成。市场上出售的植草格一般是约0.2平方米，厚约5厘米，相互连接的方块。如果将方块倒置(也就是把原先用来承载车辆的那一面朝下)．它就成为适用于屋顶花园近乎完美排水层。只要再在塑料扳的上方覆盖一层塑料滤布，植草格就能在屋顶板和种植层之间形成一层坚固、易于操作和切割而又非常轻的排水层。由于位于地表的下方，不会受到紫外线的影响，它成为一种持久耐用而又高效的排水材料。
一些新引进的由其他国家研制的产品，也同样适用于屋顶花园。其中有两种产品，它们最初投放干德国市场时，主要用于档土墙后方的排水，以取代那些沉重而难于搬运的排水石。将这两种材料平铺在屋顶表面，这些产品就会在种植层的下方形成一层轻质耐用而又能保证水的自由流动的排水层。虽然二者都是塑料制品，但是由于并不直接暴露于外向，不会受到紫外线的伤害。由粗糙的硬质塑料纤维制成，排列松散但厚度统一。为了方便运往施工现场，人们常常将长的材料卷成一卷。这两种材料的上方都应该覆盖上土工布。
继这些产品之后，还出现了其他一些产品。所有这些产品全都由耐用塑料制成的，而且只要避免太阳的长时间易晒，它们就可以发挥令人满意的防水功效。不仅如此，对于不熟练的工人来说，它们还易于操作和安装．而且一旦将其展开并根据需要修切整齐，就不需要其他额外的工作丁。
种植层下方的排水设施也可以不用覆盖整个屋顶的表面。这样的系统称为多流系统，其工作原理和为农田排水的农用瓦沟相同，只是要更为复杂一些。它由直径为2．5厘米的多孔管组成，管的主要成分是致密的聚乙烯。
这些管子彼此之间呈水平相接，管外还包有聚丙烯滤布。这个系统经常用于运动场的排水，它通过毛细管作用进行排水：多余的水分顺着屋顶的水平表面流向这些排水管，再由排水管进入屋顶的排水口。这些管道像车轮的辐条一样呈辐射状布置于屋顶的表面，同时在中央有一个固定的星顶排水口，这些管道将屋顶划分为许多彼此独立的排水区域。因而将整个屋顶合并起来看，它们就形成丁一个由各个部分共同组成的完整系统。在屋顶排水口所在的中央位置，在多流管道的末端必须铺上一层松散的碎石并覆盖上滤布，以防止土壤进入固定的屋顶排水口。
