城市景观花卉病虫害的生物防治，即是利用自然界生物种间的矛盾斗争，用有效的生物天敌或微生物及其代谢产物，来防治病虫害的方法。该方法效果持久，经济安全，不会造成环境污染，是一种很好的防治方法。
一是利用能使害虫致病致死的细菌、真菌、病毒或它们的代谢物来防治虫害。通常是人工培养害虫的致害微生物，然后制成粉剂喷洒，使害虫致死。如细菌制剂中的苏云金杆菌对鳞翅目昆虫的幼虫毒性极强，杀灭效果极佳。
试验结果表明，利用真菌灭虫的效果也很好。如用白僵菌寄生在鳞翅目、鞘翅目等昆虫及蜗类体内，能极有效地杀灭害虫。白杨虱赤座霉菌对粉虱有极高的致病力。利用病毒治虫的研究和应用同样取得了很大的进展，应用较多的是核多角体病毒。昆虫病毒的专化性很强，致病力也强，效果持久。实际应用中常将病毒制剂制成水剂、铂剂、可湿性粉剂等，喷施或施入土壤中防治虫害。
二是利用微生物间的拮抗作用及某些微生物的代谢产物，来抑制花卉致病微生物的生长、发育，甚至使其致死。这类物质即为抗生素。如代号为“5406”的花菌肥能防治某些真菌病、细菌病以及花叶病毒。
三是利用自然界中的生物食物链关系或寄生关系来防治害虫。例如，利用日光蜂防止棉蚜；利用蜻蜓、螳螂等捕食害虫等等。
还有利用植物免疫力以及植物液汁中的有效成分来防治病虫害的。如用蒜汁水溶液能防止不少种类的病菌。
利用植物生理活性物质来防止病虫害是目前国内外研究的重点，是前景很好的方法之一。此外利用生物工程方法防治病虫害也是一种新的发展趋势，如转基因技术等。
假如在园林绿化中充分利用生物防治方法，就可以从很大程度上缓解城市景观花卉病虫害防治的压力，真正跨入生态园林时代。
